Le demuxer concat de ffmpeg (depuis la version 1.1), bien pratique pour rassembler des clips pris avec mon appareil photo sans transcoder quoi que ce soit. Le plus dur a été d'avoir la 1.1 sous Debian… via deb multimedia et un peu de temps dans aptitude, ça passe.
Donc montage de clips an CLI sans peine :
avconv -i qqpart/DSCF1454.MOV -c copy -to 6 /tmp/c.mov
avconv -f concat -i list -c copy /tmp/d.mov
Première ligne, pour couper la fin (qui devenait flou…), on peut aussi couper le début avec -ss. Deuxième ligne, montage en concaténant, avec une liste des fichiers à concaténer dans "list".